Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC190Q86UF4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC190Q86UF4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC190Q86UF4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC190Q86UF4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms