Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP9Q7RTR0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP9Q7RTR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms