Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2R2Q712K3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2R2Q712K3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE2R2Q712K3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2R2Q712K3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms