Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFX8Q6ZV50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFX8Q6ZV50 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX8Q6ZV50 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms