Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDHR3Q6ZTQ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms