Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM200BQ69YZ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200BQ69YZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200BQ69YZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms