Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CARD17Q5XLA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CARD17Q5XLA6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CARD17Q5XLA6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms