Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP2LQ5T4T6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP2LQ5T4T6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2LQ5T4T6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2LQ5T4T6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms