Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM16LQ309B1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM16LQ309B1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM16LQ309B1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM16LQ309B1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms