Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-202ENST00000557865 2671 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TRMT1-214ENST00000590812 612 ntTSL 413.86□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DLG5-210ENST00000489547 861 ntTSL 313.79□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 POMT2-217ENST00000556446 556 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PITPNM3-203ENST00000572795 5369 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-211ENST00000562851 575 ntTSL 413.67□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TRMT1-210ENST00000588229 552 ntTSL 213.65□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 U73166.1-202ENST00000453717 425 ntTSL 213.61□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN1B1-205ENST00000480100 3483 ntTSL 213.6□□□□□ -0.237e-16■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-213ENST00000514179 2200 ntTSL 213.52□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-209ENST00000538753 754 ntTSL 313.51□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FTSJ1-213ENST00000496365 1287 ntTSL 513.46□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-220ENST00000544725 502 ntTSL 513.43□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RBCK1-208ENST00000414880 765 ntTSL 313.41□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-212ENST00000541866 940 ntTSL 313.31□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ANKRD27-203ENST00000586693 557 ntTSL 313.24□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT7-202ENST00000518021 768 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT7-206ENST00000519954 1209 ntTSL 313.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-215ENST00000515516 661 ntTSL 512.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-207ENST00000538375 898 ntTSL 312.73□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-235ENST00000570224 1044 ntTSL 312.49□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NOL12-201ENST00000359114 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MICAL1-205ENST00000456101 4112 ntTSL 212.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-210ENST00000531051 777 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DGKZ-209ENST00000525242 542 ntTSL 412.05□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-203ENST00000534877 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-207ENST00000530651 905 ntTSL 511.88□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-233ENST00000569457 792 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-207ENST00000555391 2509 ntTSL 211.84□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN1B1-206ENST00000535028 3886 ntTSL 211.66□□□□□ -0.547e-16■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-209ENST00000510071 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-212ENST00000515240 624 ntTSL 411.62□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-211ENST00000540408 569 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-214ENST00000542630 556 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-221ENST00000546229 744 ntTSL 311.58□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MARK4-207ENST00000590909 594 ntTSL 511.52□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZNF689-206ENST00000566673 1412 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-217ENST00000543537 802 ntTSL 511.41□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SGK494-209ENST00000530121 581 ntTSL 311.41□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 311.41□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-208ENST00000511743 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.32□□□□□ -0.63e-9■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-213ENST00000563107 733 ntTSL 511.29□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM219-207ENST00000570255 926 ntTSL 211.27□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-223ENST00000565717 947 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-213ENST00000542150 658 ntTSL 311.23□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-205ENST00000528362 546 ntTSL 211.17□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZNF689-202ENST00000563304 1207 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ACTN1-221ENST00000556571 568 ntTSL 410.98□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-213ENST00000556334 970 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-202ENST00000503573 776 ntTSL 510.91□□□□□ -0.669e-9■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TDP1-211ENST00000555178 2200 ntTSL 510.84□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 510.8□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TCOF1-204ENST00000427724 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.75□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-204ENST00000527906 604 ntTSL 310.74□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM219-206ENST00000569481 443 ntTSL 310.73□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TRMT1-205ENST00000585622 799 ntTSL 210.71□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TRMT1-221ENST00000592892 554 ntTSL 410.71□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC23A1-205ENST00000504513 406 ntTSL 510.64□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-202ENST00000434013 875 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ZNF689-204ENST00000565440 1153 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-214ENST00000563179 564 ntTSL 410.57□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-205ENST00000554432 795 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-230ENST00000561448 1443 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-210ENST00000562844 575 ntTSL 410.44□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-205ENST00000554482 583 ntTSL 210.36□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SGK494-206ENST00000526073 571 ntTSL 410.33□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PRPF38A-202ENST00000474048 1059 ntTSL 1 (best)10.27□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 PSMC3-211ENST00000531653 498 ntTSL 210.16□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SGK494-202ENST00000461399 673 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF6-214ENST00000515170 4103 ntTSL 210.12□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NAPA-212ENST00000596892 415 ntTSL 39.52□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 57.6
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