Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSTF1Q05048 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSTF1Q05048 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSTF1Q05048 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSTF1Q05048 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms