Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCEQ02156 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCEQ02156 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCEQ02156 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms