Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE1BQ01064 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE1BQ01064 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE1BQ01064 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE1BQ01064 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms