Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEX3Q00994 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEX3Q00994 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
BEX3Q00994 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BEX3Q00994 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BEX3Q00994 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BEX3Q00994 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BEX3Q00994 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BEX3Q00994 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BEX3Q00994 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BEX3Q00994 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BEX3Q00994 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEX3Q00994 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BEX3Q00994 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BEX3Q00994 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BEX3Q00994 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BEX3Q00994 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BEX3Q00994 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BEX3Q00994 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BEX3Q00994 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BEX3Q00994 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BEX3Q00994 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BEX3Q00994 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BEX3Q00994 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms