Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3F3AP84243 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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