Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP11P59045 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP11P59045 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP11P59045 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP11P59045 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms