Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTBP2P56545 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTBP2P56545 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms