Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD8P48556 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD8P48556 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms