Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX3P48380 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX3P48380 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX3P48380 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX3P48380 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX3P48380 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX3P48380 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX3P48380 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX3P48380 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX3P48380 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX3P48380 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX3P48380 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX3P48380 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX3P48380 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX3P48380 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX3P48380 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX3P48380 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX3P48380 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX3P48380 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX3P48380 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX3P48380 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX3P48380 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX3P48380 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX3P48380 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX3P48380 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX3P48380 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX3P48380 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX3P48380 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX3P48380 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX3P48380 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX3P48380 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX3P48380 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX3P48380 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX3P48380 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX3P48380 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX3P48380 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX3P48380 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX3P48380 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX3P48380 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms