Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REG1BP48304 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REG1BP48304 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REG1BP48304 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REG1BP48304 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REG1BP48304 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REG1BP48304 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REG1BP48304 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REG1BP48304 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
REG1BP48304 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
REG1BP48304 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REG1BP48304 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
REG1BP48304 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
REG1BP48304 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REG1BP48304 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REG1BP48304 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
REG1BP48304 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG1BP48304 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG1BP48304 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG1BP48304 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REG1BP48304 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REG1BP48304 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REG1BP48304 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
REG1BP48304 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REG1BP48304 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REG1BP48304 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REG1BP48304 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REG1BP48304 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REG1BP48304 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
REG1BP48304 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG1BP48304 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
REG1BP48304 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
REG1BP48304 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
REG1BP48304 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
REG1BP48304 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
REG1BP48304 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
REG1BP48304 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
REG1BP48304 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
REG1BP48304 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
REG1BP48304 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
REG1BP48304 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
REG1BP48304 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
REG1BP48304 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
REG1BP48304 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
REG1BP48304 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
REG1BP48304 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
REG1BP48304 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG1BP48304 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG1BP48304 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG1BP48304 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG1BP48304 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG1BP48304 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REG1BP48304 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms