Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIK1P39086 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIK1P39086 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK1P39086 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIK1P39086 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms