Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT2P35908 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT2P35908 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT2P35908 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT2P35908 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT2P35908 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT2P35908 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT2P35908 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT2P35908 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT2P35908 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT2P35908 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT2P35908 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT2P35908 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT2P35908 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT2P35908 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT2P35908 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT2P35908 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT2P35908 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT2P35908 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT2P35908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT2P35908 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT2P35908 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT2P35908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT2P35908 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT2P35908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT2P35908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT2P35908 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT2P35908 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT2P35908 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT2P35908 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT2P35908 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT2P35908 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT2P35908 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT2P35908 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT2P35908 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT2P35908 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT2P35908 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT2P35908 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT2P35908 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT2P35908 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT2P35908 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT2P35908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT2P35908 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT2P35908 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT2P35908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT2P35908 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT2P35908 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT2P35908 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT2P35908 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT2P35908 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT2P35908 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT2P35908 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT2P35908 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT2P35908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT2P35908 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT2P35908 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT2P35908 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT2P35908 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT2P35908 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT2P35908 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT2P35908 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT2P35908 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT2P35908 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT2P35908 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT2P35908 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT2P35908 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT2P35908 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT2P35908 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT2P35908 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT2P35908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms