Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GTF2E1P29083 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF2E1P29083 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GTF2E1P29083 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms