Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB1P20618 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB1P20618 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB1P20618 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms