Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRAP18433 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRAP18433 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRAP18433 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRAP18433 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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PTPRAP18433 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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PTPRAP18433 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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PTPRAP18433 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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PTPRAP18433 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRAP18433 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRAP18433 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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PTPRAP18433 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
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PTPRAP18433 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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PTPRAP18433 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRAP18433 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
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