Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLUP10909 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLUP10909 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLUP10909 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLUP10909 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUP10909 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLUP10909 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUP10909 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUP10909 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUP10909 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUP10909 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUP10909 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLUP10909 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLUP10909 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLUP10909 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLUP10909 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLUP10909 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLUP10909 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLUP10909 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLUP10909 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLUP10909 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms