Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI4P10075 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI4P10075 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI4P10075 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI4P10075 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI4P10075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI4P10075 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI4P10075 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI4P10075 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI4P10075 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI4P10075 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI4P10075 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI4P10075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI4P10075 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI4P10075 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI4P10075 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI4P10075 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI4P10075 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI4P10075 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI4P10075 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI4P10075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI4P10075 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI4P10075 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI4P10075 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI4P10075 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI4P10075 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI4P10075 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GLI4P10075 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI4P10075 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI4P10075 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GLI4P10075 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI4P10075 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI4P10075 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI4P10075 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GLI4P10075 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GLI4P10075 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GLI4P10075 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI4P10075 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI4P10075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GLI4P10075 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GLI4P10075 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GLI4P10075 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GLI4P10075 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GLI4P10075 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GLI4P10075 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GLI4P10075 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GLI4P10075 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms