Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM49CP0CI26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM49CP0CI26 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49CP0CI26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms