Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB1P08034 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB1P08034 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB1P08034 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB1P08034 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB1P08034 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB1P08034 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB1P08034 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB1P08034 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB1P08034 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB1P08034 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB1P08034 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB1P08034 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB1P08034 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB1P08034 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB1P08034 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB1P08034 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB1P08034 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB1P08034 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB1P08034 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB1P08034 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB1P08034 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB1P08034 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB1P08034 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB1P08034 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB1P08034 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB1P08034 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB1P08034 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB1P08034 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB1P08034 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB1P08034 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJB1P08034 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB1P08034 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB1P08034 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB1P08034 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB1P08034 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB1P08034 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB1P08034 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB1P08034 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB1P08034 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB1P08034 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB1P08034 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB1P08034 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB1P08034 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB1P08034 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB1P08034 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB1P08034 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB1P08034 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB1P08034 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB1P08034 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB1P08034 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB1P08034 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB1P08034 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB1P08034 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB1P08034 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB1P08034 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB1P08034 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB1P08034 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB1P08034 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB1P08034 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB1P08034 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB1P08034 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB1P08034 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB1P08034 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB1P08034 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJB1P08034 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB1P08034 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB1P08034 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB1P08034 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJB1P08034 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJB1P08034 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJB1P08034 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB1P08034 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB1P08034 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB1P08034 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB1P08034 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB1P08034 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB1P08034 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB1P08034 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB1P08034 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms