Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTAP01040 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTAP01040 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTAP01040 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTAP01040 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTAP01040 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTAP01040 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTAP01040 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTAP01040 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTAP01040 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTAP01040 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTAP01040 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTAP01040 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTAP01040 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTAP01040 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTAP01040 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTAP01040 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTAP01040 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTAP01040 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTAP01040 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTAP01040 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTAP01040 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTAP01040 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTAP01040 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTAP01040 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSTAP01040 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSTAP01040 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTAP01040 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTAP01040 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTAP01040 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTAP01040 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTAP01040 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSTAP01040 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTAP01040 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTAP01040 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTAP01040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTAP01040 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSTAP01040 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTAP01040 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTAP01040 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTAP01040 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTAP01040 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSTAP01040 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTAP01040 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTAP01040 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTAP01040 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTAP01040 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTAP01040 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTAP01040 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTAP01040 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTAP01040 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTAP01040 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTAP01040 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTAP01040 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTAP01040 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTAP01040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTAP01040 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTAP01040 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTAP01040 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTAP01040 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTAP01040 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTAP01040 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTAP01040 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTAP01040 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms