Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB6O95452 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB6O95452 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB6O95452 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB6O95452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB6O95452 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB6O95452 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB6O95452 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB6O95452 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB6O95452 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB6O95452 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB6O95452 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB6O95452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB6O95452 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB6O95452 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB6O95452 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB6O95452 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB6O95452 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB6O95452 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB6O95452 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB6O95452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB6O95452 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB6O95452 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB6O95452 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB6O95452 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB6O95452 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB6O95452 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB6O95452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB6O95452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB6O95452 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB6O95452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB6O95452 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB6O95452 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB6O95452 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB6O95452 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB6O95452 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB6O95452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB6O95452 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB6O95452 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB6O95452 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB6O95452 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB6O95452 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB6O95452 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB6O95452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB6O95452 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB6O95452 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB6O95452 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB6O95452 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB6O95452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB6O95452 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB6O95452 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB6O95452 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB6O95452 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB6O95452 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB6O95452 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB6O95452 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB6O95452 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB6O95452 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB6O95452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB6O95452 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms