Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL3O95236 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL3O95236 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOL3O95236 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL3O95236 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL3O95236 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL3O95236 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOL3O95236 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL3O95236 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL3O95236 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL3O95236 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL3O95236 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL3O95236 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOL3O95236 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL3O95236 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL3O95236 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL3O95236 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL3O95236 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL3O95236 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOL3O95236 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOL3O95236 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL3O95236 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL3O95236 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL3O95236 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOL3O95236 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOL3O95236 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOL3O95236 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL3O95236 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL3O95236 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL3O95236 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL3O95236 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL3O95236 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOL3O95236 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOL3O95236 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOL3O95236 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOL3O95236 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOL3O95236 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL3O95236 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL3O95236 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL3O95236 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL3O95236 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOL3O95236 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL3O95236 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL3O95236 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL3O95236 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL3O95236 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL3O95236 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOL3O95236 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOL3O95236 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL3O95236 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL3O95236 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL3O95236 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOL3O95236 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOL3O95236 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOL3O95236 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOL3O95236 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOL3O95236 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL3O95236 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL3O95236 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL3O95236 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms