Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8B1O43520 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8B1O43520 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP8B1O43520 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms