Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAFD1O14545 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAFD1O14545 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAFD1O14545 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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