Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KPNA3O00505 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KPNA3O00505 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA3O00505 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms