Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GFRA2O00451 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GFRA2O00451 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GFRA2O00451 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GFRA2O00451 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms