Protein–RNA interactions for Protein: A8K4G0

CD300LB, CMRF35-like molecule 7, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LBA8K4G0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD300LBA8K4G0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD300LBA8K4G0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD300LBA8K4G0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD300LBA8K4G0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms