Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT87PA6NCN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT87PA6NCN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT87PA6NCN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms