Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-21■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-21■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.742e-21■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 35.56□□□□□ -1.522e-21■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 TNRC18-204ENST00000413081 925 ntTSL 320.94■□□□□ 0.948e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 ARF1-206ENST00000473949 578 ntTSL 523.07■■□□□ 1.283e-12■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CFL1-205ENST00000526975 567 ntTSL 320.93■□□□□ 0.946e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.886e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CFL1-215ENST00000534784 737 ntTSL 320.22■□□□□ 0.836e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 ARF1-207ENST00000477451 789 ntTSL 518.74■□□□□ 0.593e-12■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DNAJC8-205ENST00000489277 1600 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 ARF1-202ENST00000469235 678 ntTSL 317.43■□□□□ 0.383e-12■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 ARF1-212ENST00000497165 675 ntTSL 317.33■□□□□ 0.363e-12■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.346e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CFL1-209ENST00000530413 647 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.36e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 ARF1-210ENST00000482962 597 ntTSL 316.64■□□□□ 0.253e-12■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-23■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 01e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 ARF1-211ENST00000490705 881 ntTSL 314.83□□□□□ -0.043e-12■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CFL1-213ENST00000532134 855 ntTSL 514.42□□□□□ -0.16e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 214.36□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-202ENST00000393301 598 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-209ENST00000534131 583 ntTSL 213.03□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 WDR83OS-203ENST00000598732 627 ntTSL 212.97□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-206ENST00000529974 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 WDR83OS-201ENST00000222190 599 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-207ENST00000533865 542 ntTSL 411.84□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-204ENST00000527018 733 ntTSL 511.74□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DAP-206ENST00000514882 562 ntTSL 410.67□□□□□ -0.76e-10■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 FAM193B-218ENST00000515394 589 ntTSL 210.53□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DNAJC8-206ENST00000603289 483 ntTSL 59.06□□□□□ -0.961e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-23■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.171e-23■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.181e-23■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-9■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 EWSR1-217ENST00000483415 3231 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.531e-9■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 FLNB-205ENST00000466455 404 ntTSL 319.55■□□□□ 0.727e-13■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 FLNB-207ENST00000470231 315 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.147e-13■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 PPIB-203ENST00000561048 1208 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.077e-7■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 FLNB-209ENST00000477629 2058 ntTSL 213.75□□□□□ -0.217e-13■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 PPIB-202ENST00000558492 381 ntTSL 310.6□□□□□ -0.717e-7■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 GSTP1-204ENST00000489040 523 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DHRS2-209ENST00000557535 927 ntTSL 518.97■□□□□ 0.636e-16■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 DHRS2-204ENST00000553600 844 ntTSL 216.01■□□□□ 0.156e-16■□□□□ 9.1
PCBP1Q15365 LMNA-204ENST00000368298 1475 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.612e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.562e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-216ENST00000496738 2405 ntTSL 218.22■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-217ENST00000498722 1348 ntTSL 217.75■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-209ENST00000459904 916 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9
PCBP1Q15365 BAZ2A-216ENST00000551996 849 ntTSL 512.18□□□□□ -0.464e-22■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-11■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-11■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPN2-203ENST00000373632 1073 ntTSL 514.58□□□□□ -0.083e-11■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPN2-207ENST00000462163 712 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-11■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 37.57□□□□□ -1.23e-11■□□□□ 9
PCBP1Q15365 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.044e-7■□□□□ 9
PCBP1Q15365 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)22.55■■□□□ 1.24e-7■□□□□ 9
PCBP1Q15365 PTPRF-214ENST00000496043 415 ntTSL 514.19□□□□□ -0.144e-7■□□□□ 9
PCBP1Q15365 PTPRF-213ENST00000481019 459 ntTSL 313.47□□□□□ -0.254e-7■□□□□ 9
PCBP1Q15365 DHRS2-206ENST00000556550 2595 nt14.63□□□□□ -0.071e-15■□□□□ 9
PCBP1Q15365 FASN-210ENST00000636968 100 ntTSL 518.6■□□□□ 0.577e-15■□□□□ 9
PCBP1Q15365 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 317.76■□□□□ 0.437e-15■□□□□ 9
PCBP1Q15365 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 511.37□□□□□ -0.597e-15■□□□□ 9
PCBP1Q15365 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 510.39□□□□□ -0.757e-15■□□□□ 9
PCBP1Q15365 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 521.91■■□□□ 1.12e-11■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-209ENST00000491523 698 ntTSL 324.98■■□□□ 1.598e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-203ENST00000399461 879 ntTSL 224.81■■□□□ 1.568e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-208ENST00000487034 615 ntTSL 1 (best)24.75■■□□□ 1.558e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-212ENST00000563749 2367 nt22.97■■□□□ 1.278e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.268e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-205ENST00000467736 528 ntTSL 318.66■□□□□ 0.588e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)16.97■□□□□ 0.318e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-207ENST00000484610 924 ntTSL 516.66■□□□□ 0.268e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-211ENST00000563270 554 ntTSL 416.52■□□□□ 0.248e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.178e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-213ENST00000565571 568 ntTSL 215.79■□□□□ 0.128e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.468e-9■□□□□ 9
PCBP1Q15365 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.157e-18■□□□□ 9
PCBP1Q15365 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 315.64■□□□□ 0.097e-18■□□□□ 9
PCBP1Q15365 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.347e-18■□□□□ 9
PCBP1Q15365 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.977e-18■□□□□ 9
PCBP1Q15365 TUBB4B-202ENST00000604929 2035 ntTSL 1 (best)20.54■□□□□ 0.882e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 8.9
PCBP1Q15365 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.695e-7■□□□□ 8.9
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 370.4 ms