RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368298.2

LMNA-204, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMNA, Length 1,475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-204ENST00000368298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.03■■■■■ 4.8
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LMNA-204ENST00000368298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
LMNA-204ENST00000368298 NACADO15069 1562 aa37.49■■■■□ 3.59
LMNA-204ENST00000368298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.45■■■■□ 3.59
LMNA-204ENST00000368298 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.43■■■■□ 3.58
LMNA-204ENST00000368298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.39■■■■□ 3.58
LMNA-204ENST00000368298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.34■■■■□ 3.57
LMNA-204ENST00000368298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.6■■■■□ 3.45
LMNA-204ENST00000368298 SCRIBQ14160 1630 aa36.36■■■■□ 3.41
LMNA-204ENST00000368298 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.32■■■■□ 3.4
LMNA-204ENST00000368298 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.23■■■■□ 3.39
LMNA-204ENST00000368298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.02■■■■□ 3.36
LMNA-204ENST00000368298 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.77■■■■□ 3.32
LMNA-204ENST00000368298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
LMNA-204ENST00000368298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.1■■■■□ 3.21
LMNA-204ENST00000368298 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.02■■■■□ 3.2
LMNA-204ENST00000368298 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
LMNA-204ENST00000368298 SMARCA4P51532 1647 aa34.87■■■■□ 3.17
LMNA-204ENST00000368298 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.69■■■■□ 3.14
LMNA-204ENST00000368298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.63■■■■□ 3.13
LMNA-204ENST00000368298 NCAPD3P42695 1498 aa34.61■■■■□ 3.13
LMNA-204ENST00000368298 SMARCA2P51531 1590 aa34.6■■■■□ 3.13
LMNA-204ENST00000368298 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.6■■■■□ 3.13
LMNA-204ENST00000368298 HMGXB3Q12766 1538 aa34.45■■■■□ 3.11
LMNA-204ENST00000368298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
LMNA-204ENST00000368298 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
LMNA-204ENST00000368298 WIZO95785 1651 aa34.31■■■■□ 3.08
LMNA-204ENST00000368298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
LMNA-204ENST00000368298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.64■■■□□ 2.98
LMNA-204ENST00000368298 NESP48681 1621 aa33.61■■■□□ 2.97
LMNA-204ENST00000368298 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
LMNA-204ENST00000368298 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.58■■■□□ 2.97
LMNA-204ENST00000368298 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.58■■■□□ 2.97
LMNA-204ENST00000368298 CFTRP13569 1480 aa33.45■■■□□ 2.95
LMNA-204ENST00000368298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.38■■■□□ 2.93
LMNA-204ENST00000368298 ERCC6Q03468 1493 aa33.36■■■□□ 2.93
LMNA-204ENST00000368298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.23■■■□□ 2.91
LMNA-204ENST00000368298 PRDM2Q13029 1718 aa33.21■■■□□ 2.91
LMNA-204ENST00000368298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.17■■■□□ 2.9
LMNA-204ENST00000368298 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.09■■■□□ 2.89
LMNA-204ENST00000368298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
LMNA-204ENST00000368298 CUX2O14529 1486 aa33■■■□□ 2.87
LMNA-204ENST00000368298 MRC2Q9UBG0 1479 aa33■■■□□ 2.87
LMNA-204ENST00000368298 WDR62O43379 1518 aa32.91■■■□□ 2.86
LMNA-204ENST00000368298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
LMNA-204ENST00000368298 ABCC8Q09428 1581 aa32.73■■■□□ 2.83
LMNA-204ENST00000368298 TOPBP1Q92547 1522 aa32.68■■■□□ 2.82
LMNA-204ENST00000368298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.66■■■□□ 2.82
LMNA-204ENST00000368298 CUX1P39880 1505 aa32.52■■■□□ 2.8
LMNA-204ENST00000368298 IFT140Q96RY7 1462 aa32.42■■■□□ 2.78
LMNA-204ENST00000368298 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.42■■■□□ 2.78
LMNA-204ENST00000368298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
LMNA-204ENST00000368298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.41■■■□□ 2.785e-6■■□□□ 12.5
LMNA-204ENST00000368298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.35■■■□□ 2.77
LMNA-204ENST00000368298 TOP2BQ02880 1626 aa32.33■■■□□ 2.77
LMNA-204ENST00000368298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.33■■■□□ 2.77
LMNA-204ENST00000368298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.77
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LMNA-204ENST00000368298 SOGA1O94964 1423 aa32.28■■■□□ 2.76
LMNA-204ENST00000368298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.23■■■□□ 2.75
LMNA-204ENST00000368298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
LMNA-204ENST00000368298 WDR97A6NE52 1622 aa32.12■■■□□ 2.73
LMNA-204ENST00000368298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
LMNA-204ENST00000368298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.1■■■□□ 2.73
LMNA-204ENST00000368298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.722e-7■■■■■ 37.7
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LMNA-204ENST00000368298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.94■■■□□ 2.7
LMNA-204ENST00000368298 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.91■■■□□ 2.7
LMNA-204ENST00000368298 GRIN2BQ13224 1484 aa31.88■■■□□ 2.69
LMNA-204ENST00000368298 PBRM1Q86U86 1689 aa31.81■■■□□ 2.68
LMNA-204ENST00000368298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
LMNA-204ENST00000368298 TRIM41Q8WV44 630 aa31.78■■■□□ 2.68
LMNA-204ENST00000368298 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.77■■■□□ 2.68
LMNA-204ENST00000368298 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.73■■■□□ 2.67
LMNA-204ENST00000368298 KIF27Q86VH2 1401 aa31.71■■■□□ 2.67
LMNA-204ENST00000368298 OSCARQ8IYS5 282 aa31.66■■■□□ 2.66
LMNA-204ENST00000368298 SYNJ2O15056 1496 aa31.65■■■□□ 2.66
LMNA-204ENST00000368298 CHD1O14646 1710 aa31.65■■■□□ 2.66
LMNA-204ENST00000368298 ADAMTS12P58397 1594 aa31.59■■■□□ 2.65
LMNA-204ENST00000368298 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.59■■■□□ 2.65
LMNA-204ENST00000368298 IGF1RP08069 1367 aa31.58■■■□□ 2.65
LMNA-204ENST00000368298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
LMNA-204ENST00000368298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.57■■■□□ 2.64
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LMNA-204ENST00000368298 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.37■■■□□ 2.61
LMNA-204ENST00000368298 NUP160Q12769 1436 aa31.35■■■□□ 2.61
LMNA-204ENST00000368298 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.35■■■□□ 2.61
LMNA-204ENST00000368298 EEA1Q15075 1411 aa31.31■■■□□ 2.6
LMNA-204ENST00000368298 CEP170Q5SW79 1584 aa31.29■■■□□ 2.6
LMNA-204ENST00000368298 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.22■■■□□ 2.59
LMNA-204ENST00000368298 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.21■■■□□ 2.59
LMNA-204ENST00000368298 PRXQ9BXM0 1461 aa31.2■■■□□ 2.58
LMNA-204ENST00000368298 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.16■■■□□ 2.58
LMNA-204ENST00000368298 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.16■■■□□ 2.58
LMNA-204ENST00000368298 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.16■■■□□ 2.58
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