Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL4A3BPQ9Y5P4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A3BPQ9Y5P4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A3BPQ9Y5P4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms