Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FARP1Q9Y4F1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FARP1Q9Y4F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FARP1Q9Y4F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FARP1Q9Y4F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms