Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PILRAQ9UKJ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PILRAQ9UKJ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PILRAQ9UKJ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PILRAQ9UKJ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms