Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFF4Q9UHB7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF4Q9UHB7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFF4Q9UHB7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFF4Q9UHB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms