Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV1Q9UBZ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV1Q9UBZ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV1Q9UBZ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV1Q9UBZ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REV1Q9UBZ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
REV1Q9UBZ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REV1Q9UBZ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms