Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED17Q9NVC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED17Q9NVC6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED17Q9NVC6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED17Q9NVC6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms