Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM140Q9NV12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM140Q9NV12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms