Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRC4BQ9NT99 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC4BQ9NT99 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LRRC4BQ9NT99 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LRRC4BQ9NT99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
LRRC4BQ9NT99 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LRRC4BQ9NT99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC4BQ9NT99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC4BQ9NT99 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC4BQ9NT99 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC4BQ9NT99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms