Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TULP4Q9NRJ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TULP4Q9NRJ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
TULP4Q9NRJ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TULP4Q9NRJ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TULP4Q9NRJ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms