Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS4Q9NQG7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HPS4Q9NQG7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS4Q9NQG7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms